Com a projeção por parte do Painel Intergovernamental sobre Mudanças Climáticas (IPCC), órgão ligado à Organização das Nações Unidas (ONU), de que "até o ano 2100, se nada for feito, o aumento do nível do mar pode alcançar até um metro de altura" (G1), é possível visualizar no mapa abaixo as áreas que poderão ser afetadas pelo aumento do nível do mar no Aeródromo do Centro de Lançamento de Alcântara e ao seu redor.
Por estar localizado, em média, a 40 metros de altitude, nenhuma instalação aeroportuária será afetada. No entanto, é possível observar que haverá impactos no Centro de Lançamento de Alcântara - isto é, em terras situadas em torno dos igarapés -, sem que isso afete as instalações de lançamento de foguetes, que também estão localizadas em áreas elevadas.